有分析认为，受中国产饺子致人中毒事件影响，当地检疫部门延迟了通关手续。日方准备尽早使大米通关，包括向中共政府提出要求。
日方有关人士称，此前日本大米通关只需约三周时间。这批大米到港后已经过了一个多月，期间还包括一周的春节长假，但仍未有可以通关的迹象。
日中两国政府于去年12月达成协议，日本将再对华出口150吨大米。最初的50吨已于1月初运抵天津和上海，并于当月下旬开始销售。该日方人士担心，如果通关时间被延长，“最早在3月内商店就可能断货”。
毒饺子事件发生后，中国检疫部门加强了对出口食品的检疫力度。以冷冻、加工食品为主，部分商品的对日出口一度出现了暂停。
日本水产公司曾表示，该公司在山东省的合资企业等生产的冷冻食品从2月22日起就未能出口。虽然检疫部门对工厂进行现场检查后于28日恢复了商品出口，但由于担心“其它省也可能采取相同的措施”，公司依然在搜集有关信息。加藤吉公司担心“如果出口手续继续被拖延，就不得不考虑将部分商品转回国内生产”。
日本贸易振兴机构（JETRO）日前发布贸易统计结果称，2007年对华贸易总额（不含香港）达到2366.4亿美元，首次超过对美贸易额上升至首位。日本对华贸易连续九年刷新历史记录。由于在日本相继出现食品安全问题，JETRO指出，“日本对中国的食品依赖程度较高，如果不尽快消除消费者的不安情绪，恐怕会使2008年进口额涨势受阻”。
由于中日警方在“毒饺子”事件的原因上不同调，两国原定进行的食品安全磋商将延期举行，中国质检总局局长李长江访日时间将推迟到两会以后，有分析指，尽管中日高层均强调毒饺案无碍中日关系，但调查结果不同调却可能引发外交对立危机。
