乾旱的影响已经扩散到中国的整个西南边境，中国称为澜沧江的湄公河亦面对近年来的最低水位，多个水域深度不到1米，令湄公河下游流域超过6千万依靠这条河流的居民大受影响。

其中盛产稻米的越南及泰国，自去年9月以来降雨量大减，估计水稻产量将减产三分之一。泰国有超过400万人的生活受到影响。由于湄公河水位偏低，澜沧江的西双版纳段，湄公河流经泰国境内清莱府的某些河段，缅甸北部湄公河段等，都出现船只要停航的情况。低水位亦会影响渔业，特别是濒危物种如湄公河的大鲶鱼，因为鲶鱼通常会在三、四月间游弋至湄公河上游产卵。

湄公河下游的国家包括泰国、老挝等把湄公河水位下降，归咎中国在上游地区建造水电站，导致河流乾枯。不过，中国驻泰国大使馆的官员反驳，整个湄公河流域普遍遭遇旱情，中国也是受灾国，目前湄公河水位下降是泰北和老挝的乾旱所致。他们又指，中国已完成的四个水坝规模较小，蓄水量不会对下游造成影响。

长期研究湄公河生态环境的香港民间组织，全球化监察研究统筹主任李育成表示，湄公河的水位现时可说是近30年的新低，对下游的居民影响较严重，他认为主要是由于气候变化所致。他説：水位可说是历史新低，如果情况持续下去，可能导致某些分流乾涸，其实湄公河下游国家，跟中国一样，出现旱灾，我相信这明显与气候变化有直接关是，受到厄尔尼诺现象的影响。

不过，李育成相信水坝工程对湄公河的生态环境有一定的影响，但由于中国发展水电工程的过程中，相关的信息欠缺透明度，难以科学化地评估所造成的影响。他説：以我们的观察，很难排除两者的关系，因为中共政府未能把相关的信息，特别是澜沧江上四个水坝的水文信息向外透露，有说法指中国可能担心涉及国家安全及国家机密，因此不愿分享这些信息。

李育成表示现时中国于上游地区已建成的水坝工程有漫湾、大潮山、景洪及小湾，除了小湾目前是局部运作外，其馀三个已全面运作。他建议中共政府向湄公河流域一带的国家，披露更多相关的资料，共同就水坝工程的影响进行研究。他説：水资源是上下游应共同享有，因此我们认为中共政府应该增加其透明度，向下游国家披露，特别是这四个大坝的水流下泄的流量、水位等资料。

李育成又透露，除了这四个水坝，中国正计划在上游地区再建造另外11个水坝工程，除了其中一个处于中缅边境的水坝较具争议，暂时未能落实外，政府预计会在未来十年，陆续落成10个水坝工程。