后来，中共外交部声称昆明暴恐事件现场发现了“东突”旗帜。《人民报》质疑：既然宣布杀手都是维吾尔族人，长的都是新疆人模样，还摆上“东突”旗帜干么呢，这岂不是画蛇添足?!
报导引述现场目击者的话说，非常诡异，警察来了，看到血肉横飞的场面却不开枪救人，周围民众一再大声疾呼：开枪!开枪!开枪!警察才勉强开了枪。
3月2日，海外中文网站刊登龚英辅的评论文章质疑：
1、媒体报导，发动血案的这十个人统一着黑色装。疆独分子组团发动袭击，从来没有统一着装的传统，因为统一着装，还没有到达作案现场，可能就被发现了。迄今没有看到过疆独或东突分子统一着装发动袭击案例。
2、昆明血案中，这伙人全部使用长砍刀，逢人就砍，且均是要害部位，训练有素。东突(疆独)要组织这样一次大型血案，都会使用枪，而不会都用砍刀。穆斯林恐怖组织训练杀手和死士，用各种枪，炸弹，独没有听说训练用刀砍的。他们哪怕只有一支枪，其开枪所产生的震撼和威慑作用，比用刀杀人效果更大。所有恐怖份子都喜欢用枪，特别是AK47作案。在新疆或云南两地，买到或搞到几支枪不是难事。关键是：如果东突组织有预谋的发动这次大规模袭击，会没有枪支或炸药吗?
3、东突或疆独分子在意识上均属于狂热的原教旨穆斯林分子，他们制造血案，更愿意针对政府机关、军队、公安机关，乃至政府的附属机构，以达到其所谓的政治和宣传目的。杀害儿童、妇女和老人是违背穆斯林古训的。因此，从常理上来说，东突(疆独)组织要发动一次有政治目的大规模杀人血案，昆明火车站很难会成为首选目标。
龚英辅质疑：那么这一伙实施血案的暴徒是属于哪一个组织呢?是谁在背后策划组织和提供物力财力的呢?最大可能，这次血案是冲着新领导班子深化改革和认真反腐败所策划的，是为给新领导集体主导的两会制造难堪，更主要的是企图转移视线和改变反腐败工作的方向!如果这个分析成立，这种团伙统一着装的暴力血案还可能会在其他地方重演，中央必须抓紧防范和打击!特别要防范和清理来自内部的麻烦制造者，顺藤摸瓜抓住其策划、组织和提供资助者。
退休老将军提前获悉昆明血案
此外，据新唐人电视台报导，有退休老将军事后声称，3月1日出事两三个小时之前得到内部秘密通知：“有歹徒要杀人，不要上街散步!”蹊跷的是，这位退休老将军并没住在昆明!
海外《人民报》引述知情人话透露：江系血债帮在两会前夕、在五个城市都布置了杀手，要同时下手疯狂杀戮平民。那位退休老将军是居住在其中的一个城市里。但是，那个城市并没有发生昆明那样的惨案。看来，只有云南省委忠实执行了江泽民集团的命令。
此次暴力砍人事件发生在昆明，外界也有很多猜测。有消息称，昆明是中共14军驻地，14军是由薄熙来之父薄一波创建，是薄一波的嫡系，与薄家的关系盘根错节。而14军此前被指曾参与周薄政变。
历史惊人相似再现江泽民集团导演天安门自焚伪案
历史近乎惊人的相识，此次由江泽民政变集团导演的昆明杀戮案和13年前江派一伙导演的天安门“自焚”伪案手法同出一辙，诸多疑点相似，江派政法委特种武警参与，事件当事人被灭口、中共高层事先获悉此案。
