中纪委对令计划确实照顾有加，因为令计划曾经是胡锦涛的亲信，大管家。自上个世纪1995年，令计划就担任政治局常委、中央书记处书记胡锦涛的机要秘书，2007年晋升中央书记委员候选人备考。
2012年12月初，中纪委第一次找令计划谈话，希望他能主动交代问题，为下年早春担任政协副主席创造条件。
2013年4月初，中纪委及政协党组第2次找令计划谈话，令计划向政协党组，中央政治局提出以健康理由退下。
同年(2013年)8月，中纪委第三次找令计划谈话，当时就对令计划提出警告，指其在任中央办公厅主任期间，在“政治纪律上，组织原则上，权力规范上均发生不少问题，有的情节严重。”9月初令计划提交第三次检查。9月底，令计划在中共政协党组扩大会议上做交代时痛哭流涕。
令计划在12月22日被带走时，对参加党组会议的政协副手们说：“两年九个月以来，一直惶惶不可终日，我罪有应得，是一个反面教材。”
