在台湾，陆委会副主委邱垂正表示，密切关注包括台湾保护伞餐厅发起人黄国桐在内11名港人，被香港警方以涉嫌协助12港人偷渡台湾为由拘捕的事件，呼吁港府以包容态度面对人民诉求。台湾铜锣湾书店店长林荣基认为，港人已经没有人身安全保障，呼吁尽快离开，他相信第三波大抓捕即将来临，并猜测可能针对网媒和网路言论进行肃清，确保没有人能够再批评港府。
陆委会副主委邱垂正回应香港警方的拘捕行动表示，香港今天又发生黄国桐律师等多人被抓捕事件，国际社会跟台湾，都会密切关注事件的发展。
2021年1月14日，陆委会副主委邱垂正：不要再变本加厉打压异议人士，才是维繫香港繁荣稳定的根本之道。
邱垂正说：中共既然宣称在港实施一国两制港人治港、高度自治，就应该贯彻承诺，保障并尊重港人拥有自由、民主、人权、法治的相关权利。然而，港版国安法实施以来，国际社会对相关方面伤害人权的作为屡有质疑，予以批评。
邱垂正指出，近期香港民调也显示，有高达百分之七十二的港人，对于过去一年香港的发展感到不满，也有百分之六十的民众认为，过去一年生活不快乐。
邱垂正说：我们要再次呼吁、相关方面要以包容、理性的态度，面对人民的诉求，不要再变本加厉政治打压异议人士，这台是维系香港繁荣稳定的根本之道。
台湾铜锣湾书店店长林荣基接受本台访问时表示，港府进行第一次大抓捕时，就预期会有第二次，但没想到那么快就发生。他认为港人处境目前相当危险，自身安全没有保障，呼吁能够离开的尽快离港。
林荣基说：现在香港好像史太林一样，没有办法，香港人真是不走不成。而且我担心，现在是第二波大抓捕，相信第三波陆续有来。很明显港府以借口先没收反抗者的护照，不让他们离开香港，这是不是变相限制了香港人的人身自由？我们现在不清楚他们是不是，有参与所谓12个香港人离开香港那件事。虽然港警是这样说，但是不是往后第三波又用这样的借口一路放大呢？这样真是会人人自危的。
林荣基呼吁台湾当局，在港人面对迫害的时刻，放宽并加快速度收容以政治因素申请来台港人。
林荣基说：我希望 中华民国政府，在处理一些想过来的抗争者的程序，审批加快一点。据我所知有些人是想离开，因为这边（台湾）的程序不够快，结果来不了台湾后来更被检控，我听到的情况就是这样。
林荣基认为，港府近期连续两轮大抓捕，是看准美国政权交替的时刻，没有时间对香港议题作出反应。他预估，第三波大抓捕即将来临，而是好有可能是针对网路言论进行肃清。
林荣基说：你看到国安法的内容很模糊包山包海，这样下一波是不是那些网台和写评论的人？会不会抓捕的范围再放大呢？大家都看到，香港还有很多人在网路上发表政见，对香港政府批评，下一波会不会是这些人？甚至现在看到一些网媒被搜查，他们的记者会不会有事？我担心他们会一路牵连出去。港府要的是香港人闭嘴，就是不要有任何抗争的行为。
至于黄国桐在台北市台湾大学对面成立的保护伞餐厅，今天照常营业，店内工作人员不愿就事件回应。在餐厅用餐的台大学生表示，看到新闻知道创办人被捕，特地前来用餐表达对港人支持。
