秦可卿是金陵十二钗中最早死去之人。
她的死给她的身份带来了重重迷雾。
首先是宫里的掌权太监戴权对她格外重视。秦可卿死后的首七第四日，戴权先备了祭礼遣人来，次后坐了大轿，打伞呜锣，亲来上祭。贾珍趁机替贾蓉买官，戴权只收了1200两银子，就给了个五品龙禁尉，让秦可卿出殡时有官场仪仗。
太监做为皇宫里的人，是不能随意出门，戴权大摇大摆的出现，表明秦可卿身份特殊。
其次，秦可卿死后，用的是忠义王老千岁才能用的棺木。薛蟠向贾珍提起时，贾政当场认为不妥当，但是贾珍执意为之，也让人猜疑秦可卿的身份特殊。
秦可卿不仅死后出殡规格特别高，平时她的生活中也透露出许多皇室气息。
贾宝玉到她屋里午睡时，看到的情形是这样的：武则天当日镜室中设着的宝镜，一边摆着飞燕立着吾过的金盘，盘内盛着安禄山掷过，伤了太真乳的木瓜，上面设着寿昌公主于含章殿下卧的榻，悬的是同昌公主制的连珠帐……这是物品均是历代皇家女人所用。
薛姨妈让周瑞家的送宫花，送给王熙凤后，王熙凤马上让人给秦可卿送了两朵，而对这种行为，有一首诗进行了解读：“十二宫花色最新，不知谁是惜花人。相逢若问何名姓，家住江南姓本秦。”此诗若明若暗指出，秦可卿可能来自于宫中。
秦可卿生病期间，三四个太医轮流为她诊病，她一天换四五遍衣服。这个举动让贾珍和婆婆尤氏都很担心，表面是担心她受折腾，有人认为是她在太医面前的这个举动容易暴露自己的真实身份。
还有，秦可卿死前托梦给王熙凤，她的远见卓识更显示她与众不同，尤其是她透露出贾元春即将封妃省亲，更彰显出不凡身份。
那么秦可卿真的是公主吗？
如果是公主，贾珍一个世袭的官，怎么可能在她身上功夫，闹出“爬灰”的丑闻？如果她真的是公主身份，怎么可能“淫丧天香楼”？
事实上，秦可卿的并非公主身份。
红楼梦第九回写的清清楚楚：他父亲秦业现任营缮郎，年近七十，夫人早亡。因当年无儿女，便向养生堂抱了一个儿子并一个女儿。谁知儿子又死了，只剩女儿，小名唤可儿，长大时，生的形容袅娜，性格风流。因素与贾家有些瓜葛，故结了亲，许与贾蓉为妻。
脂砚斋对此有过两种批注：
夹批为：出明秦氏究竟不知系出何氏，所谓寓褒贬、别善恶是也。秉刀斧之笔、具菩萨之心亦甚难矣，如此写出可儿来历亦甚苦矣。又知作者是欲天下人共来哭此情字。”
眉批为：写可儿出身自养生堂，是褒中贬。后死封龙禁尉，是贬中褒。灵巧至于此。
当然这两种批注写的比较含蓄，不同人可以从不同注释中得出不同结论。脂砚斋担心读者不懂，还专门留下2字批注。
红楼梦第十回，《金寡妇贪利权受辱，张太医论病细穷源》一章最后总评中，脂砚斋留下珍贵批注：欲速可卿之死，故先有恶奴之凶顽，而后及以秦钟来告，层层克入，点露其用心过当，种种文章逼之。虽贫女得居富室，诸凡遂心，终有不能不夭亡之道。
“贫女得居富室”不仅写秦可卿得病的根由，更透露出秦可卿的身份：贫女！
“贫女”这两个字是指贫家之女。秦家虽然比普通人家要好一些，但是比起贾家来说，却是贫寒之家。秦钟想到贾家学堂读书，24两拜师礼还要东挪西凑。上学期间，贾母可怜秦钟，留住留吃。秦钟死前，念念不忘的就是家里攒下的银子。这些都深刻地表明秦家其实是“贫寒之家”。所以从脂砚斋留下的批注来看，秦可卿是贫女不是公主！
