由于中共病毒疫情再度爆发，深圳盐田港出现拥堵。据全球最大航运公司马士基集团公告，船舶在盐田港延误时间延长至7~8天。盐田港是中国大陆华南最重要的货柜港，2020年，其货柜吞吐量达到1,334.85万个标准箱，年比增长2.1%。
5月21日，深圳盐田港国际货轮的登轮作业人员中，发现一例中共病毒无症状感染者，之后透过普筛又发现多名在盐田港西作业区工作人员受到感染。
据《财新网》报导，发现中共病毒感染病例之后，盐田港关闭了西区部分码头，并暂停货柜出口，导致货物积压超过两万箱。
5月31日，盐田港恢复接收出口货柜，但只限三天内离港的货物。由于港口防疫等要求增加，盐田港目前处理能力只有平时的七分之一。
财新网表示，盐田港塞港导致航运公司不得不转移船舶至周边港口，马士基已调转十艘船舶至深圳蛇口港、广州南沙港区，这也导致周边港口货运量大增。但目前蛇口港也开始执行与盐田港类似规定，6月1日起只接收五日内离港的出口货柜。
全球最大航运公司马士基集团5月31日晚公告，盐田港防疫措施变严，码头堆场密度持续升高，西区作业仍未恢复，东区生产效率仅为正常水平的30%，预计未来一周码头将继续拥挤，船舶延误时间延长至7~8天。
马士基还提示，进入盐田港运输集装箱的卡车服务也受到码头周围交通拥堵的影响，预计空车至少延迟8小时。
据《一财网》6月3日报导，由于港口拥堵，某国际物流公司职员曾辉表示，现在基本是有单来也不敢接，着急的客户我们只能走其他路线，但是运费直接翻倍。
曾辉说，“这两天有个客户去欧洲的一批货物很着急，但多个港口都没法及时发货，于是帮她从海运转为陆运，通过铁路发货了。”
曾辉表示，如果该客户走海运的话，运费大概需要1万美元，而改为陆路后，运费则提高到约2.5万美元。
深圳捷能国际物流有限公司（捷能物流）商务负责人许怡表示，“从5月31日开始预约还柜，我们就开始预约、排队，但现在的效率不及之前的三分之一，一天能还2个重柜都算好的，现在仓库还是爆仓的状态，大概还有二十多个重柜等待转移过去。”
另一位国际物流人士则说，“由于盐田港疫情影响，5月27日我们深圳13000平方米的总仓已经爆仓了。而所有国内外等待靠岸的货轮，全部在码头附近的海域排队隔离，等待检查安全后才能进入码头。”
一财网报导，此轮盐田港疫情促使深圳各港口运力更加紧张、运价上涨。