最新一期的《瞭望》新闻周刊披露种种中国科研经费黑幕。部分专家学者日前痛斥中国科研经费被转出境涉嫌“洗钱”、行贿等现象。他们建议，科研经费财权和审批权要分离，掌握财权的政府部门要从直接的科研项目审批中退出，建立科研投入基金制度和公正公平公开的专家评审制度，只有这样，国家中长期科学和技术发展规划才能顺利实现。

报道说，前一段时间国家科研经费被转出境涉嫌“洗钱”的事情较多。华东师范大学高等教育研究所所长唐安国教授指出，科研经费用于洗钱的方式有多种，一是购买设备，例如国家下拨700万元，只购买500万元设备，大笔回扣进了小金库。二是大量购买汽车房子，最后纳为私产。三是购买保险，例如，“我今年55岁，买五年养老保险，每月2000元，五年就是12万，等我退休后，这笔钱我可以取回，至少可以拿回本金，将来可以获得更多的收益”，买保险则有发票可以报账。四是合作研究，例如，“一个亿的总课题，我说需要别人合作研究，跟对方地下约定，让他开个高价，把钱打过去，再地下分赃吃回扣”。五是产业化，自己建立公司，拿科研经费作股份。六是旅游消费。

此外，院校争取来的科研经费还有可能成为向官员、专家行贿的来源。包括送回扣，有的项目经费至少拿10%打点关节。唐安国说，一般一个专家的回扣率为项目申请费用的2%至5%。还有送项目，专家评审通过了总课题，科研人员就拿子课题贿赂对方。

同济大学超大规模集成电路研究所所长林争辉教授指出，所谓高校流行俗语“跑部钱进”，就是说教育部、财政部、科技部，跑跑就有钱进。现在，有些巨额的科研审批经费掌握在少数不懂技术的行政主管部门官员手里，他们掌握生杀予夺大权，造成权力寻租、“跑部钱进”的怪现象。

中科院院士、同济大学海洋地质国家重点实验室教授汪品先教授指出，现在国家实施中长期科技发展规划，有很多大的百亿元级的科研项目。一些上亿元的大项目都让司长、处长们管着，一个处长就可以操持上亿资金。

汪品先说：“科技创新靠号召是不行的，也不是光靠投入钱可以解决的。现在国家实施中长期科技发展规划，有很多大的百亿元级的科研项目，不能让那些处长、科长们腰缠万贯，人大常委会要把每一个大项目审查管理起来，如果钱特别多，必要的话要成立专门的组。否则的话，如果大项目管理不当，资金最终流到私人腰包，达成国家中长期科技目标是不可能的。

中国的科研界近年出现了伪造、抄袭、销毁证据、妨碍调查工作等影响科研诚信的事件，为此中国科技部日前设立道德委员会，重点惩治科技界的学术腐败和学术浮躁等问题。

据一些研究人员称，目前中国政府在监督学术人员方面的措施非常有限，一些大学有时不愿对学术不端行为进行调查。这种状况最终导致大众媒体上对此类现象铺天盖地的指责和辩驳。