继区县之后，上海又在市级政府部门及下属单位中刮起新一轮审计风暴。上海市18日召开了第十二届人大常委会第38次会议上，审计局局长宋依佳受市政府委托作了关于上海市2006年度本级预算执行和其他财政收支的审计工作报告，经对上海市财政局组织执行市级预算情况和市地方税务局税收征管情况审计，发现预算问题金额约80亿元。

　　据《新闻晨报》报道，经对上海市财政局组织执行市级预算情况和市地方税务局税收征管情况审计，发现部分非税收入征缴管理不规范、部分资金未纳入部门预算管理、部分企业存在税收违规预缴情况、部分税收未及时或足额征收入库等问题。经对17个部门和下属80户一级预算单位审计，发现违规和管理不规范金额29.75亿元，占审计金额的6.17%。
　　
　　其中，市级部门存在的问题主要表现为多报预算或部门预算编报不完整，无预算、超预算支出，部分专项资金或基金被用于出借、投资以及未专款专用等；市级部门所属单位存在的问题主要表现为未严格执行政府采购制度，部分收入收缴管理不规范，部分固定资产未纳入账内管理，向关联单位收取、列支有关费用，对外投资管理不健全等。 

　　经对20个政府投资和以政府投资为主的建设项目资金使用管理情况审计，发现违规和管理不规范金额共19.46亿元，占审计资金总额的4.14%。这些问题主要表现为项目成本核算不实，超投资、多增加建设成本或形成损失浪费，部分项目概算投资编制不准确等。经对13户市管企业和下属128户子公司审计，发现违规和管理不规范金额31.06亿元。