这个协议的终结将意味着两岸最大的交易完结,斩断两岸政治关系中仅存的少数联系之一。中华民国政府官员表示,两岸经济合作框架协议的终结将只损害台湾与中国贸易的不到5%。分析人士表示,中共希望让台湾经济上更难过,但台湾已经准备好一旦中共取消协议。蔡英文总统在努力通过“新南向政策”扩大与19个南亚和东南亚其他国家的贸易关系。