不同机构的民调与预测并不一致，数量众多的亲国民党媒体民调都显示马英九领先蔡英文，联合报及TVBS民调称马领先8%，旺旺中时的民调则显示马领先3%。

台湾未来事件交易所对三名总统候选人得票预测:蔡英文(中)49.8%；马英九(左) 42.6% ；宋楚瑜10.7%。

从过往选举的经验看，这类民调往往过份高估国民党选票。有分析员认为，若国民党在这类民调未领先超过10%意谓着选情危急。

相对于这些看好马英九的民调，过去预测选举结果较为准确的政大未来事件交易所，对三名总统候选人得票预测则是蔡英文49.8%；马英九 42.6% ；宋楚瑜10.7%。

就上届总统选举来说，未来事件交易所在选前两个月预测得票率的准确度平均在95%以上，选前一天的准确度则为97.6%。

禁止交易

未来事件交易所的预测是将选举结果当作期货进行交易，以预测未来事件的结果与发生机率。这种＂预测市场＂与通过电访进行的民调本质上并不相同。

未来事件交易所一直以来并不受中选会对民调公布的相关限制，在选举日前一天还能持续预测交易，但这次总统大选，政府的中选会下令禁止其在投票日十日内预测交易。

未来事件交易所对此表示遗憾与抗议，其同时表示为尊重中选会及避免引发不必要选举纷争，自周二午后四点即停止交易。

未来事件交易所与远见杂志民调数月以来都预测目前执政的马英九将在大选中落败，远见杂志几个月前已突然宣布停止相关民调，并导致其民调中心主任辞职抗议。

政党民调

相对于媒体与民调机构一般调查规模仅在千人左右的民调，民进党民调中心则作了一份七万多个调查样本的民调。

该民调称以选前最后一个月整体选情评估，蔡英文以1%微幅领先马英九。民进党表示，若以80%的投票率来估算，1%的差距相当于10-15万票。

而另据媒体指出，国民党所作的民调则是马英九大胜蔡英文近10%。

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