中国时报报导，马英九认为，我政府应该谨慎、积极的处理这个问题，同时，也要做好相关应变的准备，因为，这不是件小事情。至於是不是最近扁政府一连串的发言引起北京的挑衅。马英九表示：选举期间，中共这样的动作相当不聪明，他希望北京能够立即停止这样的行为。
中华民国外交部代理发言人叶非比18日下午指出，中共拟於台湾海峡中线西侧开辟新航线一事，影响到台海稳定及国际飞安秩序，外交部已向各主要国家，充分说明台方的立场，并请主要国家向ICAO（国际民航组织）及中共表达关切，其中包括美国，美国了解此事的严重性，也会表达关切。
中央社报导，中共规划明年元月於台湾海峡中线西侧四点二?开辟新航线，引发国内外关注。叶非比下午指出，由於此事影响到台海稳定及国际飞安秩序，外交部已经向各主要国家，充分说明我方的立场，未来中华民国将持续与这些国家沟通。
叶非比指出，美国也觉得这个问题很严重，他们也会有所行动；外传国际民航组织已同意中共开辟新航线，叶非比说，目前台湾并未得到这样的讯息。叶非比在外交部例行记者会，答覆媒体询问中共有意在台海中线西侧规划新航线，她指出，中共此举将严重影响台海稳定及国际飞安秩序，国际上几个主要国家已向中共表达严重关切，台湾也持续与这些国家沟通，政府团队陆续透过多种可能管道，表达台湾的诉求。
至於外传国际民航组织已同意中共开辟航线，叶非比说，目前台湾并未得到这样的讯息。而经常透露华府内幕的「尼尔森报导」日前指出，受入联公投冲击，美国可能不愿意在国际民航组织声援台湾。
叶非比表示，中华民国在第一时间得知中共有意在台海中线西侧划定新航线讯息，就立刻向美国国务院、行政部门提出台湾的关切，「美国也觉得这个问题很严重，他们也会有所行动」。叶非比指出，尼尔森的报导常把不同的事情连结，但入联公投与中共划新航线应该是两个独立的议题。