回到自己的军舰上后,林遵马上通知各舰长和炮艇艇长马上到旗舰开紧急会议,告知了自己的投共计划,并征求大家意见。最后以无记名投票形式决定是否投共,结果8篇赞成,2票反对,6篇弃权。林遵遂宣布第二舰队1271名官兵、30艘舰艇全体投共。也是在这一天,1949年4月23日,因为林遵的投共,中共不费一弹一炮顺利占领了国民政府所在地南京。而国民党听说林遵投共后,大吃一惊,立即派出6架飞机,轰炸舰艇,林遵居然指挥各舰反击。
投共后“重庆号”官兵的命运,真的如他们从书中看到的、从中共党员所描绘的那般美好吗?在中共发动的历次运动中,他们逃脱了吗?令人叹惋的是,事实上,绝大多数人的命运都很悲惨。《参加重庆号巡洋舰武装起义》透露,参加叛变的一个叫于家欣的水兵,当时曾接到青岛的嫂子来信,称中共在胶东地区推行“土改”,他的地主父亲和哥哥被镇压了,嫂子要求他为父兄报仇。然而,早已受中共思想蛊惑的于家欣却称“多年不知父兄情况,家庭小事,不影响参加起义”。
派往英国学习的400多名海军学员,其中有一个19岁名叫毕重远的成员乃是中共南京地下党员。他在前往英国学习前,中共给其的指示是:长期埋伏,积蓄力量,以待时机,特别要注意很好地隐蔽自己;中共将来也要建设自己的海军。