在里应外合下，南京被共军顺利占领。晚年的陈修良对当年南京地下党的“功绩”还念念不忘。她最大的遗憾是当年许多南京地下党在1949年后被打成“特嫌”、“右派”和“右倾机会主义分子”，陈修良也包括在内，但她却不曾反思为何自己全心效命的中共，如此对待他们。 2006年12月7日大陆知名作家傅国涌的博客一篇题为《“降级安排，控制使用，就地消化，逐步淘汰”——另一个鲜为人知的十六字方针》的文章披露，中共篡政后，对如何处理南京市委领导的地下党，毛泽东有过一个十六个字方针：“降级安排，控制使用，就地消化，逐步淘汰。”有人曾经拿这十六个字问过前中国社会科学院副院长、2003年谢世的李慎之先生，他不无感慨地说：“怕不止是南京，是对全国地下党的。”
