同年10月，庞同善继续进攻，在金山路上遇到高丽大军10多万人，被打的落荒回逃，高丽军追的兴起，薛仁贵率本部兵马冲杀出来，将敌人大军拦腰截断，敌军大乱，薛仁贵领兵奋力杀敌，此战杀的昏天暗地，敌人数不剩数，最后薛仁贵大败高丽军，斩首五万人。(注意啊，斩首多少人并不是敌人的总兵力，而指的只是斩杀的人数，并没有算逃跑等的人数)唐军乘胜攻占南苏(今辽宁抚顺东苏子河与浑河交流处)、木底(今辽宁新宾西木奇镇)、苍岩(今吉林集安西境)3城，与泉男生部会合，赢得了金山之战的胜利。高宗亲笔写诏书慰劳仁贵：“金山大阵，凶党实繁。卿身先士卒，奋不顾命，左冲右击，所向无敌，诸军贾勇，致斯克捷。宜善建功业，全此令名也。”金山之战是唐初年的罕见的大规模遭遇战，是灭高句丽四大战役最关键，最大的一次战役，基本消灭高句丽精锐部队，为彻底胜利奠定基础，此战由薛仁贵亲自指挥，功不可没。
同年的11月下旬，薛仁贵仅带2000人的兵马向前进军，发兵扶余城(今吉林四平)，有的将领大力反对，认为人实在太少了，搞砸了不好收场但是薛仁贵说：“兵不在多，顾用之何如。”不在多少，就看你主将会不会用，历史上能说出这样“大话”的将军也没有几个。兵贵神速，接着一场人类战争奇迹又出现了。高丽派出数万大军快速出兵新城，想夺回主动权，这正好就应了薛仁贵的道了。当敌人行军的时候根本无法想象唐军居然会那么快就打过来.时逢冬天，东北大地，白雪蔼蔼，薛仁贵2000玄甲骑兵全部着白衣。当他们发现敌人的时候，薛仁贵当机立断，利用骑兵平原优势，冲杀敌人。于是在白色的雪域平原上，正在行军的高丽兵看见一大团白色飞冲而来，还以为是雪崩呢。薛仁贵指挥杀敌，用了7个时辰，不到15个小时的时间斩杀俘虏敌人万余，剩余军队四散溃逃，这次战役也要看出唐玄甲军的战斗力恐怖之处，据考证这是最早利用保护色的战役。
接着薛仁贵率领2000将士继续前进，乾封三年(668)，薛仁贵的部队攻占坚固的扶余城。之后高丽连续40多座城市直接向薛仁贵投降，薛仁贵声名鹊起，威震辽海，神威四方，自此，高丽所最惧怕之人为薛仁贵。
就这样薛仁贵大军沿途破城抵达平壤城下，与从行军大总管李绩等诸路大军会师平壤，大军合围，攻破平壤，薛仁贵亲自接受高丽国王投降，根据史料记载，高丽国国王高藏在向薛仁贵投降签字的时候，连抬头看薛仁贵的勇气都没有，威慑力到了何种地步。真有张辽使江东小孩夜不敢哭的风采。自此，隋唐几代帝王灭亡高丽的愿望终于在高宗这里得到了实现.如果仔细研读过这段史料的话，大家会很清楚，高丽实为薛仁贵所灭，他起了关键和决定性的作用，而并非是李绩。
可是呢，后世史书上却把征东的大功劳给了李绩。薛仁贵在灭高丽四大战役，新城、金山、扶余、平壤中的金山和扶余起到了决定性的作用，其中消灭有生兵力最多的金山之战，和破城最多的扶余之战几乎由薛仁贵独立打胜的，同时他也参加了大部队都参加的平壤战役，并且救援了新城，没有让李绩的错误导致战局的崩盘，所以灭高丽的关键性人物是薛仁贵。后世百姓也著写《薛仁贵征东》以纪念这位英雄人物。
高丽杨广3次征讨，唐太宗再次次征讨均告失败，虽说薛仁贵时期，高丽内部有政治分裂。但是薛仁贵能灭，可见其实力。
之后，高宗命薛仁贵率兵留守平壤，并授薛仁贵为右威卫大将军，封平阳郡公，兼检校安东都护。薛仁贵受命后，移治平壤新城。他任安东都护期间，做为地方长官，表现出了杰出的政治才能，立即投身于恢复和平，恢复生产，医治战争创伤的工作中。史书说他这时抚养孤儿，赡养老人，治理盗贼，提拔任用高丽的人才，表彰奖励品德高尚、行为优异的百姓，一时间高丽人都非常喜悦，忘记了亡国之痛。(史书原文为“抚孤存老，检制盗贼，随才任职，褒崇节义，高丽士众皆欣然忘亡。”)
从这里看出可以使人忘记亡国之痛，可见薛仁贵的政治才能是非常出众的，同样他又当上了看门将军，不过是中国东大门的看门将军，也应了守天下之门这一说。总章二年(669)薛仁贵编撰《周易新本注义》这是世界第一部辨证法理论的军事著作，军事价值很高，很了不起.这时期是薛仁贵最风光的时期，是他人生的顶点，但是人会有低潮的时候，随后薛仁贵进入自己人生的最低点。
人生总有低落时，花甲饮恨青海湖 要说薛仁贵一生中唯一的败仗，那就是青海大非川之败了，有的只知道薛仁贵简单事迹的人，看见薛仁贵的评论总会说，唐朝初年薛仁贵青海大非川大败，是唐初最大的败绩，导致丢失安西四镇等重大损失，我只能说我很无奈，当不了解一件事情的真实情况的时候，请不要妄加评论。
吐蕃进军西域，薛仁贵已经56岁了，只要稍稍仔细了解就可以知道薛仁贵的在这场战争中的计谋。唐书中有这样的一句话“乌海险远，车行艰涩，若引辎重，将失事机，破贼即回，又烦转运。彼多瘴气，无宜久留。大非岭上足堪置栅，可留二万人作两栅，辎重等并留栅内，吾等轻锐倍道，掩其未整，即扑灭之矣。”这是主帅薛仁贵同副将郭待封之间的一段对话，意思就是乌海路途远而且险要，车很难行动，如果带着辎重走的话，就把破敌的机会给延误了，我们打败敌人就班师回朝，如果再把辎重从远处来回搬运很麻烦。这地方瘴气很浓，大部队不留太久，这地方的地形正好适合安营扎寨，给你2万人留在这里看辎重粮草，我带兵快进破敌人。注意这句话“破贼即回，又烦转运”，灭完敌人就班师回朝了，运送辎重很麻烦，薛仁贵为什么要说这句话?难道吐蕃军会立刻主动来找他?就地与唐军结束战斗?那薛仁贵为什么要轻装前进去找吐蕃军?这不又走远了，况且这是大仗，不是消灭一万人可以解决问题的，为什么呢?这就是薛仁贵的计谋了--抛砖引玉，他前进到乌海干掉吐蕃一万来人，他算得出吐蕃一定会判定唐军这样的速度攻击，一定是轻装部队，而粮草肯定是放在后方了，吐蕃一定会马上集中兵力去找唐军的粮草，因此他的军队集结会仓促，后魏元忠弹劾薛仁贵的一句话也证明了这点“彼吐蕃蚁结蜂聚，本非勍敌，薛仁贵、郭待封受阃外之寄，奉命专征，不能激励熊罴，乘机扫扑。”而且这是吐蕃和土谷浑的联军，而他到达郭待封的防守的地方的时候，郭待封是据险而防守，以益待劳，用2万军队守城当住20万仓促集结的军队，阻挡他一段时间没问题，这时候薛仁贵再杀回来，薛仁贵的军队是乘胜而回，鼓励他的将士，是去救兄弟，而且是救粮食去了，等到薛仁贵回，吐蕃那是疲惫之师，薛仁贵从后面出现，郭待封再出来，这是前后夹击，10万军队就可以大破吐蕃20万，这就是为什么他说运送辎重麻烦，因为他想的就是把吐蕃军勾引出来，然后就地全部解决，薛仁贵之前可用2000人干掉好几万人过，这是多么周密的计谋啊，兵法曰“军马未动，粮草先行”有人问了，薛仁贵这不是犯兵家大忌吗?恩，他就犯了，真正的艺术型军事指挥家是因地制宜的使用计谋的，书是死的，人是活的，只会按部就班的将军打不出漂亮仗。咱开国大将陈庚还使用过两次埋伏的计谋，这不也是兵家大忌吗?可是人家是大胜.可见薛仁贵的计谋到的何等地步。按照安排，吐蕃基本就栽在这里了，可是因为一个人，这一切都成设想了。
那个人就是薛仁贵的副将，名将郭孝恪的二儿子，郭待封，也就是给薛仁贵看粮草的那个，那郭待封是名门之后，并且出征前官位甚至和这个农民出身的薛仁贵一样高，凭什么当他的副将啊，所以书上就写了“多违节度”，总违反命令。按照开始的计划实施，薛仁贵先打到乌海，胜利了，砍死一万来人。这下一步就完蛋了，郭待封没听薛仁贵的，继续带着粮草前进，薛仁贵知道这事情以后差不多就预感要完了，他再带部队回去接郭待封，在平地上让敌人的优势兵力给包围了，那就彻底完了，他下令让郭待封快点走，郭待封也没急行军。等快到了乌海了，还没碰上薛仁贵呢，人家吐蕃的20万军队真出来了，郭待封这小子把粮草辎重全丢了。薛仁贵听到这个，也就知道基本完蛋了。然后吐蕃纠集60万军队和薛仁贵这支7万人无粮食的军队决战，还是归于薛仁贵能打啊，才能保下一些军队，吐蕃应该也损失很多，否则他完全可以杀了薛仁贵，为什么不杀呢，他被薛仁贵这种气势给震住了，他们想象的到，这次他们利用了唐军将帅不和的矛盾，取得了胜利，但是如果再来一个薛仁贵，他们就受不了了，可以后世唐朝再鲜有薛仁贵这样的人物了。这次战争并没有全军覆没，且《旧唐书》上也没有记载，只是宋的《新唐书》和《资治通鉴》写了，但是议和罢兵和全军覆没明显矛盾，旧唐书的记载应该是真的。本来这场战争完全可以压制住吐蕃，估计也不会发生92年之后长安被攻破的惨景了。
