之后克凌斯博士再次研究“尼安德特人”骸骨线粒体DNA（mtDNA）高变区II的基因，证实尼安德特人的mtDNA落在与现代人mtDNA相关的系统发育树之外，进一步支持了1997年的研究结果——“尼安德特人”不是现代人的祖先。论文1999年在权威期刊《美国国家科学院院刊（PNAS）》上发表⁸⁷。
总之，来自不同的研究共同否定了“尼安德特人是现代人类的祖先物种”的结论。即使后来的《科学》⁸⁸和《自然》⁸⁹杂志报导了尼安德特人与现代人基因之间的极其微小的相似性，也并没改变“尼安德特人”不是人类祖先的结论。
露西不是人猿共同祖先
1974年，人们在东非发现的化石标本“露西”，属于“南方古猿阿法种”，曾被认为是人猿的共同祖先。
如果是一个“猿人始祖”的骨架，应该具有介于人和猿猴之间的共同特点。人四肢关节几乎是直的、伸展的，猴子四肢关节经常是弯曲的。这些在解剖上很容易辨别出来。
可是，纽约州立大学健康科学中心解剖学家杰克‧斯特恩（Jack Stern）和兰德尔‧苏斯曼（Randall Sussman）1983年在《美国体质人类学杂志》（American Journal of Physical Anthropology）发表文章指出，南方古猿膝部没有明显程度的现代特征，膝关节的整体结构与很大程度的树栖运动相容，而且它具有典型的树栖类动物的长而弯曲的手指和脚趾⁹⁰。
虽然当1983年《纽约时报》的文章《露西真的用自己的双脚站起来了吗？》发表时，科学家还在为反对或支持露西直立行走的不同观点⁹¹争论，可是当后来越来越多的证据被发现之后，露西的真实身份就浮出水面了。
原西澳大利亚大学解剖学和人类生物学教授查尔斯‧奥克斯纳德（Charles Oxnard）博士对南方古猿化石进行复杂的计算机分析，结论认为南方古猿与人类的祖先没有关系，而只是一种已灭绝的猿类。这一结论于1987年发表在华盛顿大学出版的《化石、牙齿和性：人类进化的新视角》书中。（The australopithecines may well have been sibling groups to both the African apes and humans. This is an idea that would remove the australopithecines from being closely related to the human lineage and would place them unequivocally within an evolutionary radiation. Of these lineages，some，australopithecines，became extinct；some African apes，are almost extinct；only one genus，Homo，survives strongly at the present time.）⁹²
斯坦福大学计算机科学博士大卫‧A‧普莱斯蒂德（David Plaisted）教授在北卡罗来纳大学教堂山分校网站上发表的标题为“露西和颅骨1470的问题”的文章中，引用了上述的斯特恩、苏斯曼和奥克斯纳德三个人的观点和证据。⁹³
2012年《科学》杂志文章分析了南方古猿阿法种个体的肩胛骨化石，发现它保留了攀爬的特征，是个活跃的攀爬者⁹⁴。
所以众多证据表明，南方古猿阿法种是一种绝种的猿。露西作为猿人始祖的地位已经不成立。
尽管如此，人们还是把露西（Lucy）做成了雕像，安上了人的手脚，放在了博物馆里面，让人误以为Lucy就是人和猿的共同祖先，让大众误以为人是猴子变来的。
拼凑的爪哇人
1891年，荷兰内科医生、解剖学家尤金‧杜巴斯（Prof. Dr. Eugene Dubois，1858—1940）在印尼爪哇桑吉兰（Sangiran，Island of Java，Indonesia）河滩内发现一块头盖骨、一块股骨和三颗牙齿；拼在一起作为历史久远的“爪哇人（Java man）”。
后来，人们对这个标本提出了很多质疑。首先，不清楚这些骨头是否来自同一物种，很可能是拼凑的。一些科学家认为杜巴斯的发现只是一只猿，另一些科学家则认为这是一具患病的现代骨骼，还有一些人认为是现代人类股骨和猿人头盖骨的混合体。剑桥大学的解剖学家亚瑟‧基思爵士（Sir Arthur Keith，1866—1955）研究发现，最初发现的头盖骨显然来自当今人类，它的脑容量在当今人类脑容量范围之内。⁹⁵
被称为“病理学之父”的病理学家维尔啸（Rudolf Virchow）教授在一开始为发现“爪哇人”而兴奋，他亲自拜访了杜巴斯，还邀请他到柏林演讲，并在1895年发表了六篇关于这一新发现的论文。尽管如此，维尔啸还是无法接受把杜巴斯的发现作为人类进化树的补充。无可否认，股骨具有原始人的特征，而头盖骨更像猿。他将这些遗骸归类为两种不同的生物，他认为病态的股骨来自于人类，而头骨残骸来自于一只巨型长臂猿。⁹⁶
总之，所有这些曾经被人们认为“人类祖先”的化石——“尼安德特人”和“露西”，已经被认为不是“人类祖先”；“爪哇人”是不同动物骨头拼凑出来的东西；还有后文会介绍的“皮尔敦猿人”和“内布拉斯加男子”被发现是欺诈，没有一个能被证实成为人和猿猴的古代祖先。
假设的“猿人”先祖，至今根本没有找到。“人从猴子进化而来”的假设，没有得到化石的验证。
4.没有恐龙和鸟之间的中间物种
始祖鸟（Archaeopteryx）曾经被认为是恐龙和鸟类之间的中间物种，被用来证明达尔文进化论。
然而，根据对始祖鸟的研究，始祖鸟的羽毛、骨骼、大脑结构和内耳结构都非常类似于现代鸟类。⁹⁷始祖鸟的内耳结构显示它具有良好的听力和平衡感。
北卡罗来纳大学动物学系的艾伦‧费杜西亚（Alan Feduccia）还在《科学》（Science）上指出，始祖鸟主要飞行羽毛中的羽片符合现代飞鸟的不对称模式——不对称特征的意义在于表明了它们飞行的能力⁹⁸。这里说明一下，现代飞鸟的身体轮廓羽毛是对称的，不对称性主要体现在飞行羽毛，特别是前缘与飞行气流紧密接触的羽片的不对称性尤其明显。
这些特征表明，始祖鸟已经具备了飞行的必要条件，而不是在进化过程中的过渡阶段。
始祖盗龙（Archaeoraptor）化石据称是自始祖鸟化石以来从肉食恐龙进化成鸟的最佳证据。德克萨斯大学奥斯汀分校地质科学系的蒂莫西‧B‧罗（Timothy B. Rowe）博士对来自中国的早白垩世地层产生的始祖盗龙化石的研究2001年3月发表在《自然》上，罗博士的研究发现所谓的化石是伪造品，是一种恐龙的尾巴和一种原始鸟类骨骼的混合物⁹⁹。
这篇文章的共同作者包括地质科学系的科学家理查德‧A‧凯查姆（Richard A. Ketcham）博士和助理研究员马修‧科尔伯特（Matthew Colbert）博士、前脊椎动物古生物学实验室的坎布里亚‧丹尼森（Cambria Denison）博士及中国北京中央研究院古脊椎动物、古人类学研究所的徐星（Xing Xu）和位于加拿大阿尔伯塔省德拉姆赫勒的王家泰瑞尔古生物博物馆的菲利普‧J‧柯里（Philip J. Currie）博士。
因此，众多证据表明，始祖鸟不是鸟和恐龙之间的中间物种，也不存在两者之间的中间物种。
5.化石直接否定“进化假说”
前面我们提到，英国化石专家帕特森博士因为发现没有一块化石能证明进化假说，所以不愿意用虚假的化石来误导大众。这可以说是帕特森领悟到“进化假说”的错误后的一次初步觉醒，那么美国古生物学家古尔德对化石的研究则是一个更本质的提升。
20世纪70年代，美国哈佛大学古生物学教授斯蒂芬‧杰伊‧古尔德（Prof. Dr. Stephen Jay Gould，1941—2002）对世界各地的化石从整体上进行重新评估之后认为，绝大多数生物化石的历史都包涵两个与渐进式的进化假说有冲突的特点¹⁰⁰：
(1)稳定性：多数物种在地层中出现时，与它们消灭时的外形几乎是完全一样的。即使有外形的改变，也都十分有限，并且没有显示进化的方向。
(2)突然出现：世界各地调查的结果证实，任何物种并非由“始祖”逐渐改变而来；相反的，各种生物出现时都已经“全部完成”了。
简而言之，如果进化意味着一种生物逐渐变成另一种生物，那么化石记录的突出特点就是缺乏进化证据。
举个例子，考古学家发现的一种叫“三叶虫”的古代生物，从6亿年到2.6亿年前都生存在我们这个地球上，2.6亿年之后就消失了。三叶虫被证明是史前生物中最持久的一种。从发现它到它完全消失中间经过了3亿4千万年，但是三叶虫还是三叶虫，它完全没有出现什么进化。它居然经过了3.4亿年都没有发生进化直到它自然消失。这也很可能证明进化论是不存在的又一个非常有力的证据。
所以，化石不但不能支持进化假说，而且还深度质疑了“慢慢演化”的可能。
化石的稳定和突然出现否定了进化假说。（大纪元制图）
6.寒武纪化石提示：生命大爆发
约5.41亿至4.854亿年之前的寒武纪标志着地球生命史上的一个重要时刻。
在寒武纪之前，没有复杂的动物，化石记录非常稀少。1909年在加拿大的伯基斯页岩中，人们发现了大量寒武纪时期的海洋动物化石。这些化石包括20至35个不同门类的生物，如节肢动物、腕足动物、蠕形动物、海绵动物和脊索动物等。已知有超过17,000个物种幸存至2.5亿年前的二叠纪。这个现象被称为寒武纪生命大爆发（Cambrian Life‘s Explosion）¹⁰¹。
寒武纪标志性的节肢动物是三叶虫。三叶虫有扁平的、分段的、镀层的身体，这有助于在捕食者越来越多的海洋中保护它们。三叶虫有许多品种和大小，长度从1毫米到超过2英尺（0.6米）不等，被证明是最成功和最持久的史前动物之一。
考古学家在中国澄江化石群的研究中也发现类似的现象，证实了生命的突然出现。他们在澄江发现了5.3亿年前许多不同种类的动物化石，包括海绵、水母、触手类、虫类、天鹅绒虫、腕足类、各种节肢类以及最高等级的脊索或半脊索动物。¹⁰²
根据达尔文进化假说，生物应该经历长期缓慢的演化过程，累积微小变异，并通过自然选择逐渐进化为新的“属”、新的“科”和新的“门”。考虑到寒武纪时期出现的大量物种，它们必然经历了漫长的演化过程，但为什么化石记录中没有完整地记录下这些过程呢？化石记录应该是随机的，为什么恰恰缺失了寒武纪之前的过渡环节呢？
这是一个非常关键的问题。事实上，很可能是由于生命起源的方式不是漫长演化，而是一个突然出现的事件，可能真的存在着一个所谓的“生命起源”时期。
1972年美国哈佛大学古生物学教授古尔德和美国自然历史博物馆馆长、古生物学家尼尔斯‧埃尔德里奇（Prof. Dr. Niles Eldredge，1943—）共同提出“间断平衡理论（punctuated equilibrium）”，认为物种经历长期停滞，然后在相对较短的时期内经历孤立事件，如重大地质灾难的形成，发生快速变化，然后保持长时间稳定性，在此期间生物体几乎不会发生进一步的变化¹⁰³。
总之，寒武纪生命大爆发确实是一个非常奇特的事件，毫无疑问，这个发现已经给进化假说带来了重要挑战。
7.线粒体DNA研究：人类和大部分动物年龄相同
超市里每种物品都有条形码，作为识别它们的标志；与之类似，地球上不同物种之间的鉴别也有位于基因上、能代表这个物种标志的条形码，称为DNA条形码（DNA barcoding），这种DNA条形码依赖于基因组的短的、高度可变的区域。
对动物物种的鉴定，通常采用线粒体细胞色素c氧化酶亚基I（cytochrome c oxidase I，COI）基因作为通用DNA条形码序列。¹⁰⁴
2018年《人类进化》杂志上发表了来自纽约洛克菲勒大学的高级研究助理马克‧斯托克尔（Mark Stoeckle）和瑞士巴塞尔大学的大卫‧塞勒（David Thaler）的一篇研究论文，他们与全世界数百名研究人员对100,000个动物物种、来自美国GenBank数据库中的500万个基因快照的研究发现，根据同一物种不同个体的COI区域的核苷酸多样性，就可以计算出这一物种最早出现时的年龄。¹⁰⁵
这项研究最令人吃惊的结果也许是，对于地球上的大部分物种来说，DNA条形码的COI遗传多样性“大致相同”。也就是说，今天地球上十分之九的物种，包括人，鸟、鱼、熊等，都是在10万到20万年前形成的，而不是像进化树描绘的那样慢慢演变而来的。
这个研究被多个主流媒体网站转载，包括雅虎、英国追踪最新科学资讯的“物理网”（Phys.Org）¹⁰⁶。法新社记者马洛‧胡德（Marlowe HOOD）对研究者做了专访并发表了评论文章，认为生物物种突然大量出现的这一发现与进化论假说所认为的“物种通过演变慢慢产生”是截然不同的。研究者之一大卫‧塞勒受访时，把它称为“达尔文的困惑”。
Phy.Org¹⁰⁷的另一篇来自洛克菲勒大学的文章指出，这项研究的另一个有趣的发现是，从基因的特点来看，很难找到“中间物种”——物种之间进化的垫脚石。塞勒博士接受采访时表示：“达尔文理解’中间物种缺失的原因‘仍然是个很大的难题。”
塞勒博士补充道：“这项研究是一种新方法，表明物种是’序列空间中的岛屿’。每个物种都有自己狭窄的、非常具体的共识序列，就像我们的电话系统有简短的、独特的数字代码来区分城市和国家一样。”
塞勒博士还说：“如果个体是恒星，那么物种就是星系。它们是浩瀚空序空间中的致密星团。”
《进化杂志》（Evolution News&Science Today）的一篇评论文章则以“人类和动物（大部分）年龄相同？”为标题，彰显了与进化假说截然不同的关于生物起源的发现¹⁰⁸。
而这个研究似乎与寒武纪生物突然大量出现的现象显示了一个共同的规律——也就是说生命似乎总是在某个时期突然大量出现，而不是慢慢演化出来的。
人类需要认真审视并研究这个问题，以更加开放的心态接纳、吸收或提出新的理论，才能更好地找到生命起源的真正答案。
8.化石讲述了一个什么故事？
通常动植物死亡后的尸体很快就会消失，因为食腐动物和微生物很快就会把它们分解掉。大量的动植物化石之所以被保存下来，是因为这些化石在死后很快被埋葬。除非迅速掩埋，而且接下来很快发生了石化作用，否则多数生物的遗体将无法保存。
化石现象其实正好提示了灾难事件的存在。地质学的记录表明灾难性事件是存在的，有化石的地质学年代，可能正好是发生灾难的年代。¹⁰⁹（详见《第八章》）
2021年11月8日，《The Deseret News》报纸发表了题目为Why this300 million-year-old fossil discovered in Utah has the paleontology world buzzing的文章¹¹⁰，报导了在犹他州的峡谷地国家公园出土了一个清晰的、3亿年前脊椎骨骼遗骸的化石，约1.5英尺（45.72厘米）长，有着类似哺乳动物的脊椎骨，比最古老的恐龙化石还要早5,000万年。按照达尔文的进化假说，最早有脊椎的哺乳动物是出现在约2.05亿年前早侏罗世的摩尔根兽¹¹¹，可是它的身长只有10厘米，和一只家鼠差不多大小。3亿年前怎么会出现这个这么巨大的脊椎动物呢？
按照进化假说，人类从植物、动物、猿人、巧人（能人）、直立人、智人等慢慢“进化”而来，直到大约在公元前1万年左右新石器时代出现现代人¹¹²。可是地质学发现，提示在早期人类出现之前的更久远年代，就已经存在人类的脚印，让人们越来越困惑¹¹³。（详见《第八章》）
总之，寒武纪化石证明的生命大爆发的现象、线粒体DNA研究所发现的人类和大部分动物在地球上产生的年龄相同以及上述3亿年前出现巨大的脊椎动物等等这些事实，构成了对达尔文进化假说有力的冲击。
化石不但不支持进化假说，而且似乎还在讲述着另一种生命起源的故事，这个版本不同于达尔文版本的“渐进演化”的概念。
地球上的生物物种不太可能像达尔文所讲的那种单一、线性、慢慢演化而来，用那种模型难以解释科学家的发现，科学家的发现一致性地提示——地球上生命的产生更可能是类似一种多次、重复、爆发式的模式。
也就是说，在非常久远的年代，生命爆发式产生之后，因遇到灾难性事件而灭绝；然后再次产生，再次灭绝，往复循环，这样似乎才能比较合理地解释上面所陈述的各种科学研究发现。（待续）
参考文献：
75. Darwin, Charles. On the origin of species by means of natural selection, or, The preservation of favoured races in the struggle for life. London: J. Murray,1859.
