中国新型冠状病毒肺炎（下称武汉肺炎）疫情严峻，也影响当局“两会”（人大和政协会议）这项重要政治议程。每年3月的中共两会，今年是否能如期开会?有消息指，中共最高层习近平与李克强两派常委为此发生激辩，未有最终结论。
中央社1月29日报导，每年年初，中国大陆各地都会举行一年一度的省级地方两会。而在新型冠状病毒肺炎疫情全面爆发前，主要省份地方两会均已陆续开完，因此许多中国民众质疑，湖北省和武汉市隐匿疫情，是为了会议期间稳定？
1月26日，中共武汉市民族宗教事务委员会前主任王献良，因感染新型冠状病毒肺炎病亡。目前不清楚王献良是否参加了地方两会。1月28日，湖北原黄石市市长杨晓波也因“重症肺炎”去世。据称杨是在参加湖北省两会期间被传染，确诊两天后即病亡。消息引发疫情已经在政府官员中传播的猜测。
疏理报导发现，从12月8日确诊第一例“武汉肺炎”，到1月23日武汉封城。超过一个月时间的关键转折点是1月20日习近平作出指示，之后是病例激增，各地陆续启动重大突发公共卫生事件一级响应，封城、进入所谓战时状态。但病毒已随人流蔓延全国和全球多个国家和地区。
政论作家，时局分析人士陈破空认为，疫情隐瞒是从上而下的，在中国，实际上是中央政府直接垄断信息。
综合陆媒报导，未开省级两会的云南、四川省先后于本月27、28日宣布延后原订2月初举行的两会，具体召开时间另行通知。山东济南、青岛、滨州，河南郑州、平顶山、安阳，安徽合肥，浙江舟山，陕西铜川、商洛等地级市，也都陆续延后两会时间。黑龙江绥化市也宣布目前没召开两会的县（市、区），延后到2月8日之后召开。
中央社称，中共第13届全国人民代表大会第3次会议和政协第13届全国委员会第3次会议，原来预计于3月5日和3月3日在北京开幕，目前官方尚未宣布会否延后。
而据《苹果日报》披露，传武汉肺炎疫情之下3月是否还开两会，引发中共高层权斗。
报导引用美国中文媒体的消息称，在25日的政治局常委紧急会议中，除了决定武汉封城之外，常委们还有讨论对疫情扩散的看法，及是否如期在3月3日和5日，召开全国政协和全国人大会议。
该议题引发常委分成两派，以习近平为主的习派常委认为应如期举行，目的是要对外表现所谓太平盛世，“鼓舞”及“稳定”人心；但以李克强为主的其他常委却认为武汉肺炎是“国难”，将会影响大陆经济数字，政府工作报告亦需修正，建议延期召开。据报，两派常委激烈争辩，未有最终结论。
该次会议宣布为对疫情危机，特别成立“中共中央应对新型冠状病毒感染肺炎疫情工作领导小组”，该小组组长不是总书记、国家主席习近平，而是国务院总理李克强，外界有揣测指或是习近平有意卸责。
27日，武汉新型冠状病毒肺炎出现1个多月，刚兼任国务院总理、中央应对新型冠状病毒感染肺炎疫情工作领导小组组长的李克强，亲自抵达抗疫一线武汉考察抗疫工作。李强调说是受“习近平总书记委托”。
不过，习28日会见世卫总干事谭德塞时称“对于这一次的疫情防控工作，我一直是在亲自指挥、亲自部署”，被指有为退居二线“辟谣”之意。但习的这句话后被官媒新华社删除。
德国之声援引曾任德国驻中国大使史丹泽的话表示，武汉肺炎对中共领导人是一大威胁，这是习近平统治权威首度受到质疑。
香港著名时事评论员萧若元认为，今次疫情严重程度，堪比史上最大核爆切尔诺贝利事故，或导致全国上百万人死亡。中共政治局最近会议，已知道疫情或挑战到中共权威，走到亡党的阶段，目前重点是保住11个城市包括香港等，未来两三天疫情最关键，呼吁民众自救。
而在疫情爆发之际，中央政法委书记郭声琨1月17日在中央政法工作会议上传达习近平指示：2020年中共政法委工作要将“维护国家政治安全”放在第一位。外界认为，似乎中南海暗示今年中共政权有大患。
习近平1月20日对武汉肺炎疫情做出指示，也要求遏制疫情蔓延却不忘强调要“坚决维护社会大局稳定”。不少分析都认为，中共高层在这次抗疫行动中极之混乱，而且确有具政治考虑。
武汉市长周先旺1月27日在接受央视访问时，针对外界批评武汉疫情信息隐瞒，周先旺透露一个敏感的细节：隐匿疫情是因“中央不授权”。
政论家伍凡认为，这次疫情至少在三个层面影响深远，特别是中共的封城行动，不但引发中国社会将大动荡，而武汉市长“带头抗命”习近平，说明中共党内也会大动荡。
资深政经评论家林保华则认为，武汉肺炎病例高速增加，各地方政府以不同方式抗疫，令中央极权面临崩解。
