所谓天灾，必然出现在世间混乱之时。按照古籍的说法，人间是由天上的神在管的，当人间有不好的人和事出现时，就会有灾难出现。这种理解在《封神演义》中就有，吕岳在封神台上被封为“瘟癀昊天大帝”之职，是瘟神鼻祖。这样说来，瘟疫也是有神在管的。
《封神演义》中，主管瘟疫的吕岳大帝，统辖6位瘟部正神，各自的手下有瘟鬼无数，瘟鬼将瘟疫散在何处，那一地就会出现瘟疫，他们也是按照神的有序安排具体实施而已。
宋朝初年的一代道家宗师陈抟，曾在他的一篇传世之作《心相篇》中论述了瘟疫的缘由：“瘟亡不由运数，骂地咒天。”人死于瘟疫不在人命运的定数之内，是因为人不敬神佛，不敬天地带来的灾难。瘟疫是人心不正招来的。
明代文学家冯梦龙的《警世通言》中也有提到瘟疫出现的原因。
一、天降瘟疫只因人间怨气
却说汉灵帝时十常侍用事，忠良党锢，谗谄横行，毒流四海，万民嗟怨。那怨气直达上苍，降下两场大灾，久雨之后，又是久旱。那雨整整的下了五个月，直落得江湖满目，厨灶无烟。及至水退了，又经年不雨，莫说是禾苗槁死，就是草木也干枯了。可怜那一时的百姓，吃早膳先愁晚膳，缝夏衣便作冬衣。正是朝有奸臣野有贼，地无荒草树无皮。壮者散于四方，老者死于沟壑。（出自《警世通言》第四十卷旌阳宫铁树镇妖）
二、医官做“救饥丹”一丸四十天
时许都有一人姓许名琰，字汝玉，乃颖阳许田之后。为人慈仁，深明医道，擢太医院医官。感饥荒之岁，乃罄其家资，置丸药数百斛，名曰“救饥丹”，散与四方食之。每食一丸，可饱四十余日。饥民赖以不死者甚众。（出自《警世通言》第四十卷旌阳宫铁树镇妖）
在瘟疫面前，上天有好生之德，总是希望那些好人不在惩罚淘汰之列，想出各种的方法来救他们。正如《警世通言》中的医官许琰能够做出“救饥丹”也是天意。得救之人其实都是一些品行好的人。
