中共总书记习近平就事件作了几点批示，包括禁用六四方式(即动用军队)处理香港社会问题、禁驻粤部队调往香港、禁大陆舆论发表进一步激化大陆和香港之间矛盾及怀疑一国两制实践的言论等。显示中共最高领导人并不希望用激化手段处理香港问题。
接近中南海知情人士透露，旺角事件发生后，中共中央港澳工作协小组立即召开紧急会议，听取了港澳办、中联办对事件的汇报，协调小组长张德江在会上传达了中共总书记、国家主席习近平就旺角事件所作的几点重要指示，其主要精神如下：
特区政府要依法处理肇事分子，严格区别以间离香港和大陆关系及「港独」为目的一小撮肇事分子，以及那些切身利益受损而参与事件的多数市民的不同；采取措施切实维护好香港安全，避免事态进一步复杂化；要进一步安怃民众；缓和社会气氛。
特区政府要尽量避免擦枪走火和暴力「镇压」手段对待社会和平抗议活动以及不同声音；对一些激进的暴力抗议行动，要根据香港的法律采取应对，要将一切不稳定因素尽量消除在萌芽状态。
当年北京处理「六四事件」、调动军队的方法对香港不适用。驻港部队必须严格按照中央军委的指示驻守香港，不得擅自动作；同时，没有中央军委命令，驻粤部队绝对不可有针对香港的军事动作。
加强大陆舆论导向，禁止任何进一步激化大陆和香港之间矛盾、甚至怀疑「一国两制」实践的言论，避免被一小撮别有用心的香港反对派和境外势力利用，煽风点火，为他们的颠覆香港的阴谋背书。
