虽然牛奶能补充大量维生素、矿物质和蛋白质，但大量饮用也可能使人患上与激素相关的癌症，如乳腺癌、前列腺癌，并引起痤疮。
一方面，牛奶富含饱和脂肪，这意味着，喝大量牛奶会提高血脂水平，阻塞动脉，增加患心脏病的风险。
另一方面，根据美国佛罗里达州注册营养师伊沙尼·尤因的说法，暂时鲜有证据证明吃乳制品与得心脏病之间有直接联系。而且，2012年，一项针对45至84岁年龄群的研究发现，其实，相比于乳制品，肉类包含的饱和脂肪更容易导致心脏病。另一份2014年发布的报告也支持食用奶制品并不会影响人的血脂水平这一观点。
不过，纽约市营养顾问艾米·夏皮罗说，要判断一个人能否大量摄入饱和脂肪，更重要的还是要知道其家族本身有没有心脏病史，如果有，夏皮罗建议最好在咨询医生后，限制该成分的摄入，并把牛奶换成它的某种替代品。
根据《美国饮食指南》，饱和脂肪在每日卡路里摄入量中所占的比例不要超过10%，美国心脏协会更是建议把这个占比降到6%。
除了心脏病，一项2020年的研究还发现，喝牛奶的女性比喝豆奶的女性更容易得乳腺癌。相似的是，男性如果日常饮用牛奶，可能会得前列腺癌。可是，营养师艾米说，有关牛奶是如何导致这两种癌症的问题，还需要更多的调查。
“关键还是看一个人的整体饮食模式，这对患上癌症的概率的影响，要远远大于其中某一种食物（如牛奶），”营养师艾米补充道。
对于14到18岁的青春期女生，2005年的一项研究发现，喝牛奶还可能会导致她们长痘痘。关于原因，调查人员怀疑是这些奶制品会增加人体中某些激素的分泌，产生更多皮脂，这是一种皮肤上的油性蜡状物，最终可引起痤疮。但是，尚无随机对照实验证实过这种联系。
“可以试试少喝牛奶，如果你觉得自己长痘和这有关系的话，说不定就会有改善的效果，”营养师艾米说，“只要你保证自己能从其他食物中获取足够的钙和维生素D。”
然而，即使现在我们已能买到牛奶、奶酪的替代品，天然奶制品在饮食中仍是不可或缺的，因为它们能提供其他食物所没有的大量营养。《美国饮食指南》甚至建议，一个人每天最好喝三杯牛奶，或等量的其他乳制品，以保证钙、钾和维生素D的摄入量达标。
