然而，就在前线捷报频传之际，后方已悄然失火。斯大林的指令，从北伐开始第一天就已下达，那就是：趁蒋介石出兵在外，后方兵力空虚之际，在后方持续制造动乱。
1926年7月，北伐军攻克长沙，湖南农民运动也随之展开。共产党领导的农民协会在湘中各县迅速扩张，至1926年底、1927年初达到高潮。而毛泽东正是在1927年1至2月间亲赴湖南考察，写下那份著名的《湖南农民运动考察报告》的。
换句话说，北伐军打到哪里，农民协会就在后面扩张到哪里，利用权力真空，趁势夺取农村控制权，这也是共产党宣传的所谓“农村包围城市”战略的真实一面。
中共在湖南组建的农民协会，打出的口号是“有土皆豪，无绅不劣”，有田产者皆是“土豪”，穿长袍马褂者皆是“劣绅”，“一切权力归农会”。在农会挟持之下，地痞流氓趁势而起，大肆冲入士绅家中杀猪抢粮、抓人游街，甚至当众处决，掘坟刨棺。
毛泽东在《湖南农民运动考察报告》中，详细记录了种种此类行径。但是，他非但不加批判，反而大加赞赏，称这是“革命的先锋”“好得很”。
北伐军中，下级军官十之八九出身中小地主家庭，农民运动所冲击的，正是这些人的父兄亲眷。第三十五军军长何键的父亲，竟被五花大绑游街示众。第七军军长李宗仁后来在回忆录中写道，两湖部队的将士，眼见家人遭此凌辱，心中愤懑已濒临爆发。北伐军的怒火，不仅指向军阀，也愈来愈指向身后那只兴风作浪的黑手。
